phpDocumentor
[ class tree: phpDocumentor ] [ index: phpDocumentor ] [ all elements ]

Source for file Io.inc

Documentation is available at Io.inc

  1. <?php
  2. /**
  3.  * File and input handling routines
  4.  * 
  5.  * This class parses command-line options, and works with files to
  6.  * generate lists of files to parse based on the ignore/include options
  7.  * 
  8.  * phpDocumentor :: automatic documentation generator
  9.  * 
  10.  * PHP versions 4 and 5
  11.  *
  12.  * Copyright (c) 2000-2006 Joshua Eichorn, Gregory Beaver
  13.  * 
  14.  * LICENSE:
  15.  * 
  16.  * This library is free software; you can redistribute it
  17.  * and/or modify it under the terms of the GNU Lesser General
  18.  * Public License as published by the Free Software Foundation;
  19.  * either version 2.1 of the License, or (at your option) any
  20.  * later version.
  21.  * 
  22.  * This library is distributed in the hope that it will be useful,
  23.  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  24.  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU
  25.  * Lesser General Public License for more details.
  26.  * 
  27.  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  28.  * License along with this library; if not, write to the Free Software
  29.  * Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA
  30.  *
  31.  * @package    phpDocumentor
  32.  * @author     Joshua Eichorn <jeichorn@phpdoc.org>
  33.  * @author     Gregory Beaver <cellog@php.net>
  34.  * @copyright  2000-2006 Joshua Eichorn, Gregory Beaver
  35.  * @license    http://www.opensource.org/licenses/lgpl-license.php LGPL
  36.  * @version    CVS: $Id: Io.inc 286921 2009-08-08 05:01:24Z ashnazg $
  37.  * @filesource
  38.  * @link       http://www.phpdoc.org
  39.  * @link       http://pear.php.net/PhpDocumentor
  40.  * @since      0.1
  41.  */
  42. /**
  43.  * Class to handle file and user io opperations
  44.  *
  45.  * @author    Joshua Eichorn <jeichorn@phpdoc.org>
  46.  * @author     Gregory Beaver <cellog@php.net>
  47.  * @version    $Id: Io.inc 286921 2009-08-08 05:01:24Z ashnazg $
  48.  * @package     phpDocumentor
  49.  */
  50. class Io 
  51. {
  52.    
  53.     /**
  54.      * Holds all the options that are avaible to the cmd line interface
  55.      * and to the different web interfaces
  56.      */
  57.     var $phpDocOptions;
  58.     /**
  59.      * Format: array(array(regexp-ready string to search for whole path,
  60.      * regexp-ready string to search for basename of ignore strings),...)
  61.      * @var false|array
  62.      */
  63.     var $ignore;
  64.     /**
  65.      * A specific array of values that boolean-based arguments can understand,
  66.      * aided by the {@link decideOnOrOff()} helper method.
  67.      * 
  68.      * Use lowercase letters always, to simplify string comparisons
  69.      * @var array 
  70.      */
  71.     var $valid_booleans = array
  72.     (
  73.         ''' ''on''y''yes''true''1'
  74.         'off''n''no''false''0'
  75.  
  76.     );
  77.    
  78.     /**
  79.      * creates an array $this->phpDocOptions and sets program options in it.
  80.      * Array is in the format of:
  81.      * <pre>
  82.      * [filename][tag][] = "f";
  83.      * [filename][tag][] = "-file";
  84.      * [filename][desc] "name of file to parse"
  85.      * </pre>
  86.      */
  87.     function Io()
  88.     {
  89.         $this->phpDocOptions['filename']['tag'array"-f""--filename");
  90.         $this->phpDocOptions['filename']['desc'"name of file(s) to parse ',' file1,file2.  Can contain complete path and * ? wildcards";
  91.         $this->phpDocOptions['filename']['type'"path";
  92.  
  93.         $this->phpDocOptions['directory']['tag'array"-d""--directory");
  94.         $this->phpDocOptions['directory']['desc'"name of a directory(s) to parse directory1,directory2";
  95.         $this->phpDocOptions['directory']['type'"path";
  96.  
  97.         $this->phpDocOptions['examplesdir']['tag'array"-ed""--examplesdir");
  98.         $this->phpDocOptions['examplesdir']['desc'"full path of the directory to look for example files from @example tags";
  99.         $this->phpDocOptions['examplesdir']['type'"path";
  100.  
  101.         $this->phpDocOptions['templatebase']['tag'array"-tb""--templatebase");
  102.         $this->phpDocOptions['templatebase']['desc'"base location of all templates for this parse.";
  103.         $this->phpDocOptions['templatebase']['type'"path";
  104.  
  105.         $this->phpDocOptions['target']['tag'array("-t""--target");
  106.         $this->phpDocOptions['target']['desc'"path where to save the generated files";
  107.         $this->phpDocOptions['target']['type'"path";
  108.        
  109.         $this->phpDocOptions['ignore']['tag'array("-i""--ignore");
  110.         $this->phpDocOptions['ignore']['desc'"file(s) that will be ignored, multiple separated by ','.  Wildcards * and ? are ok";
  111.         $this->phpDocOptions['ignore']['type'"path";
  112.  
  113.         $this->phpDocOptions['ignoresymlinks']['tag'array("-is""--ignoresymlinks");
  114.         $this->phpDocOptions['ignoresymlinks']['desc'"ignore symlinks to other files or directories, default is off";
  115.         $this->phpDocOptions['ignoresymlinks']['type'"set";
  116.         $this->phpDocOptions['ignoresymlinks']['validvalues'$this->valid_booleans;
  117.  
  118.         $this->phpDocOptions['ignoretags']['tag'array("-it""--ignore-tags");
  119.         $this->phpDocOptions['ignoretags']['desc'"tags to ignore for this parse.  @package, @subpackage, @access and @ignore may not be ignored.";
  120.         $this->phpDocOptions['ignoretags']['type'"value";
  121.  
  122.         $this->phpDocOptions['hidden']['tag'array("-dh""--hidden");
  123.         $this->phpDocOptions['hidden']['desc'"set equal to on (-dh on) to descend into hidden directories (directories starting with '.'), default is off";
  124.         $this->phpDocOptions['hidden']['type'"set";
  125.         $this->phpDocOptions['hidden']['validvalues'$this->valid_booleans;
  126.  
  127.         $this->phpDocOptions['quiet']['tag'array("-q""--quiet");
  128.         $this->phpDocOptions['quiet']['desc'"do not display parsing/conversion messages.  Useful for cron jobs on/off default off";
  129.         $this->phpDocOptions['quiet']['type'"set";
  130.         $this->phpDocOptions['quiet']['validvalues'$this->valid_booleans;
  131.  
  132.         $this->phpDocOptions['undocumentedelements']['tag'array("-ue""--undocumentedelements");
  133.         $this->phpDocOptions['undocumentedelements']['desc'"Control whether or not warnings will be shown for undocumented elements. Useful for identifying classes and methods that haven't yet been documented on/off default off";
  134.         $this->phpDocOptions['undocumentedelements']['type'"set";
  135.         $this->phpDocOptions['undocumentedelements']['validvalues'$this->valid_booleans;
  136.  
  137.         $this->phpDocOptions['title']['tag'array("-ti","--title");
  138.         $this->phpDocOptions['title']['desc'"title of generated documentation, default is 'Generated Documentation'";
  139.         $this->phpDocOptions['title']['type'"value";
  140.  
  141.         $this->phpDocOptions['help']['tag'array("-h""--help");
  142.         $this->phpDocOptions['help']['desc'"    show this help message";
  143.  
  144.         $this->phpDocOptions['useconfig']['tag'array("-c","--useconfig");
  145.         $this->phpDocOptions['useconfig']['desc'"Use a Config file in the users/ subdirectory for all command-line options";
  146.         $this->phpDocOptions['useconfig']['type'"value";
  147.  
  148.         $this->phpDocOptions['parseprivate']['tag'array("-pp","--parseprivate");
  149.         $this->phpDocOptions['parseprivate']['desc'"parse @internal and elements marked private with @access.  Use on/off, default off";
  150.         $this->phpDocOptions['parseprivate']['type'"set";
  151.         $this->phpDocOptions['parseprivate']['validvalues'array('on''off');
  152.  
  153.         $this->phpDocOptions['packageoutput']['tag'array("-po","--packageoutput");
  154.         $this->phpDocOptions['packageoutput']['desc'"output documentation only for selected packages.  Use a comma-delimited list";
  155.         $this->phpDocOptions['packageoutput']['type'"value";
  156.  
  157.         $this->phpDocOptions['defaultpackagename']['tag'array("-dn","--defaultpackagename");
  158.         $this->phpDocOptions['defaultpackagename']['desc'"name to use for the default package.  If not specified, uses 'default'";
  159.         $this->phpDocOptions['defaultpackagename']['type'"value";
  160.  
  161.         $this->phpDocOptions['defaultcategoryname']['tag'array("-dc","--defaultcategoryname");
  162.         $this->phpDocOptions['defaultcategoryname']['desc'"name to use for the default category.  If not specified, uses 'default'";
  163.         $this->phpDocOptions['defaultcategoryname']['type'"value";
  164.  
  165.         $this->phpDocOptions['output']['tag'array("-o","--output");
  166.         $this->phpDocOptions['output']['desc'"output information to use separated by ','.  Format: output:converter:templatedir like \"HTML:frames:phpedit\"";
  167.         $this->phpDocOptions['output']['type'"value";
  168.  
  169.         $this->phpDocOptions['converterparams']['tag'array("-cp","--converterparams");
  170.         $this->phpDocOptions['converterparams']['desc'"dynamic parameters for a converter, separate values with commas";
  171.         $this->phpDocOptions['converterparams']['type'"value";
  172.  
  173.         $this->phpDocOptions['customtags']['tag'array("-ct","--customtags");
  174.         $this->phpDocOptions['customtags']['desc'"custom tags, will be recognized and put in tags[] instead of unknowntags[]";
  175.         $this->phpDocOptions['customtags']['type'"value";
  176.  
  177.         $this->phpDocOptions['sourcecode']['tag'array("-s","--sourcecode");
  178.         $this->phpDocOptions['sourcecode']['desc'"generate highlighted sourcecode for every parsed file (PHP 4.3.0+ only) on/off default off";
  179.         $this->phpDocOptions['sourcecode']['type'"set";
  180.         $this->phpDocOptions['sourcecode']['validvalues'array('on''off');
  181.  
  182.         $this->phpDocOptions['javadocdesc']['tag'array("-j","--javadocdesc");
  183.         $this->phpDocOptions['javadocdesc']['desc'"JavaDoc-compliant description parsing.  Use on/off, default off (more flexibility)";
  184.         $this->phpDocOptions['javadocdesc']['type'"set";
  185.         $this->phpDocOptions['javadocdesc']['validvalues'array('on''off');
  186.  
  187.         $this->phpDocOptions['pear']['tag'array("-p","--pear");
  188.         $this->phpDocOptions['pear']['desc'"Parse a PEAR-style repository (package is directory, _members are @access private) on/off default off";
  189.         $this->phpDocOptions['pear']['type'"set";
  190.         $this->phpDocOptions['pear']['validvalues'array('on''off');
  191.  
  192.         $this->phpDocOptions['readmeinstallchangelog']['tag'array("-ric","--readmeinstallchangelog");
  193.         $this->phpDocOptions['readmeinstallchangelog']['desc'"Specify custom filenames to parse like README, INSTALL or CHANGELOG files";
  194.         $this->phpDocOptions['readmeinstallchangelog']['type'"value";
  195.  
  196.         $this->phpDocOptions['general']['message'="You can have multiple directories and multiple files, as well as a combination of both options";
  197.     }
  198.  
  199.    
  200.     /**
  201.      * create the help message for display on the command-line
  202.      * @return string a string containing a help message
  203.      */
  204.     function displayHelpMsg()
  205.     {
  206.         unset($ret);
  207.         $ret "\n";
  208.         foreach($this->phpDocOptions as $data)
  209.         {
  210.             unset($tag);
  211.             $tag "";
  212.             if (isset($data['tag']))
  213.             {
  214.                 if (is_array($data['tag'])) {
  215.                     foreach($data['tag'as $param{
  216.                         $tag .= "$param    ";
  217.                     }
  218.                 }
  219.         $taglen 34;
  220.         $outputwidth 79;
  221.         $tagspace str_repeat(" ",$taglen);
  222.                 $tmp "  ".trim($tag).$tagspace;
  223.                 $tmp substr($tmp,0,$taglen);
  224.                 $d wordwrap(ltrim($data['desc']),($outputwidth-$taglen));
  225.         $dt explode("\n",$d);
  226.         $dt[0$tmp .$dt[0];
  227.         for($i=1;$i<count($dt);$i++)
  228.         {
  229.             $dt[$i$tagspace.$dt[$i];
  230.         }
  231.         $ret .= implode("\n",$dt)."\n\n";
  232.        
  233.             }
  234.         }
  235.         $ret .= "\n".wordwrap($data['message'],$outputwidth)."\n";
  236.         return $ret
  237.     }
  238.    
  239.     /**
  240.      * calls {@link file_exists()} for each value in include_path,
  241.      * then calls {@link is_readable()} when it finds the file
  242.      * @param string 
  243.      * @return boolean 
  244.      */
  245.     function isIncludeable($filename)
  246.     {
  247.         $test realpath($filename);
  248.         if ($test && is_readable($test)) {
  249.             return true// for absolute paths
  250.         }
  251.         $ip get_include_path();
  252.         if (PHPDOCUMENTOR_WINDOWS)
  253.         {
  254.             $ip explode(';'$ip);
  255.         else {
  256.             $ip explode(':'$ip);
  257.         }
  258.         foreach($ip as $path)
  259.         {
  260.             if ($a realpath($path DIRECTORY_SEPARATOR $filename))
  261.             {
  262.                 if (is_readable($a))
  263.                 {
  264.                     return true;
  265.                 }
  266.             }
  267.         }
  268.         return false;
  269.     }
  270.  
  271.     /**
  272.      * Parses $_SERVER['argv'] and creates a setup array
  273.      * @return array a setup array
  274.      * @global array command-line arguments
  275.      * @todo replace with Console_* ?
  276.      */
  277.     function parseArgv()
  278.     {
  279.         global $argv;
  280.  
  281.         // defaults for setting
  282.         $setting['hidden'"off";
  283.         $setting['ignoresymlinks''off';
  284.         $setting['template''templates' PATH_DELIMITER .'default' PATH_DELIMITER;
  285.  
  286.         $valnext "junk";
  287.         $data array();
  288.         if(isset($argv&& is_array($argv))
  289.         {
  290.             foreach ($argv as $cmd)
  291.             {
  292.                 if ($cmd == '--'{
  293.                     continue;
  294.                 }
  295.                 if ($cmd == '-h' || $cmd == '--help')
  296.                 {
  297.                     echo $this->displayHelpMsg();
  298.                     die();
  299.                 }
  300.  
  301.                 // at first, set the arg value as if we
  302.                 // already know it's formatted normally, e.g.
  303.                 //    -q on
  304.                 $setting[$valnext$cmd;
  305.  
  306.                 if (isset($data['type']&& $data['type'== 'set'{
  307.  
  308.                     if ($valnext !== 'junk' && strpos(trim($cmd),'-'=== 0{
  309.                         // if valnext isn't 'junk' (i.e it was an arg option) 
  310.                         // then the first arg needs an implicit "" as its value, e.g.
  311.                         //     ... -q -pp ...  ===>  ... -q '' -pp ... 
  312.                         $setting[$valnext'';
  313.  
  314.                     else if (!in_array(strtolower($cmd)$data['validvalues']true)) {
  315.                         // the arg value is not a valid value
  316.                         addErrorDie(PDERROR_INVALID_VALUES$valnext$cmd,
  317.                             '(' implode(', '$data['validvalues']')');
  318.                     }
  319.                 }
  320.  
  321.                 foreach$this->phpDocOptions as $name => $data )
  322.                 {
  323.                     if (!empty($data['tag']))
  324.                     {
  325.                         if (in_array($cmd,$data['tag']))
  326.                         {
  327.                             $valnext $name;
  328.                             break;
  329.                        
  330.                         else
  331.                         {
  332.                             $valnext "junk";
  333.                         }
  334.                     }
  335.                 }
  336.  
  337.                 if ($valnext == 'junk' && (strpos(trim($cmd),'-'=== 0)) {
  338.                     // this indicates the last arg of the command 
  339.                     // is an arg option (-) that was preceded by unrecognized "junk"
  340.                     addErrorDie(PDERROR_UNKNOWN_COMMANDLINE,$cmd);
  341.  
  342.                 else if ($valnext != 'junk' && (strpos(trim($cmd),'-'=== 0)) {
  343.                     // this indicates the last arg of the command 
  344.                     // is an arg option (-) without an arg value
  345.                    
  346.                     // add an empty arg "value" for this arg "option"
  347.                     $setting[$valnext'';
  348.                 }
  349.  
  350.  
  351.             }
  352.         else
  353.         {
  354.             echo "Please use php-cli.exe in windows, or set register_argc_argv On";
  355.             die;
  356.         }
  357.         /* $setting will always have at least 3 elements
  358.         [hidden] => off
  359.         [ignoresymlinks] => 'off'
  360.         [template] => templates/default
  361.          */
  362.         if (count($setting4{
  363.             echo $this->displayhelpMsg();
  364.             die();
  365.         }
  366.  
  367.         return $setting;
  368.     }
  369.  
  370.  
  371.     /**
  372.      * @return array list of files in a directory
  373.      * @param string $directory full path to the directory you want the list of
  374.      * @param bool whether to list files that begin with . like .bash_history
  375.      * @param bool whether to ignore symlinks
  376.      */
  377.     function dirList($orig_directory$hidden false$ignore_symlinks false)
  378.     {
  379.         $directory realpath($orig_directory);
  380.         $ret false;
  381.         if (@is_dir($directory))
  382.         {
  383.             die("directory: '$directory'  not found\n");
  384.         }
  385.         $ret array();
  386.         $d @dir($directory)// thanks to Jason E Sweat (jsweat@users.sourceforge.net) for fix
  387.         while($d && ($entry=$d->read()) !== false{
  388.             if (strcmp($entry,"."== || strcmp($entry,".."== 0{
  389.                 continue;
  390.             }
  391.  
  392.             // skip hidden files, if we're supposed to
  393.             if (!$hidden)
  394.             {
  395.                 if (substr($entry,0,1== ".")
  396.                 {
  397.                     phpDocumentor_out("Hidden " $directory PATH_DELIMITER $entry " Ignored\n");
  398.                     continue;
  399.                 }
  400.             }
  401.  
  402.             // skip symlink files, if we're supposed to
  403.             if ($ignore_symlinks)
  404.             {
  405.                 if (is_link($directory PATH_DELIMITER $entry))
  406.                 {
  407.                     phpDocumentor_out("Symlink " $directory PATH_DELIMITER $entry " Ignored\n");
  408.                     continue;
  409.                 }
  410.             }
  411.            
  412.             if (is_file($directory PATH_DELIMITER $entry)) {
  413.                 $ret[$directory PATH_DELIMITER $entry;
  414.             }
  415.             if (is_dir($directory PATH_DELIMITER $entry)) {
  416.                 $tmp $this->dirList($directory PATH_DELIMITER $entry$hidden$ignore_symlinks);
  417.                 if (is_array($tmp)) {
  418.                     foreach($tmp as $ent{
  419.                         $ret[$ent;
  420.                     }
  421.                 }
  422.             }
  423.         }
  424.         if ($d$d->close();
  425.         return $ret;
  426.     }
  427.  
  428.     /**
  429.      * Retrieve common directory (case-insensitive in windows)
  430.      *
  431.      * takes the list of files, and returns the subdirectory they share in common,
  432.      * so in this list:
  433.      *
  434.      * <code>
  435.      * array(
  436.      * "/dir1/dir2/subdir/dir3/filename.ext",
  437.      * "/dir1/dir2/subdir/dir4/filename.ext",
  438.      * "/dir1/dir2/mydir/dir5/filename.ext");
  439.      * </code>
  440.      *
  441.      * getBase will return "/dir1/dir2"
  442.      * @param array array of strings
  443.      */
  444.     function getBase($filelist)
  445.     {
  446.         $masterPath false;
  447.         foreach($filelist as $path)
  448.         {
  449.             if (!$masterPath)
  450.             {
  451.                 $masterPath str_replace('\\','/',dirname($path));
  452.             else
  453.             {
  454.                 if (dirname($path!= $masterPath)
  455.                 {
  456.                     $mp explode(PATH_DELIMITER$masterPath);
  457.                     $np explode(PATH_DELIMITERstr_replace('\\''/'dirname($path)));
  458.                     if (count($npcount($mp))
  459.                     {
  460.                         $masterPath join($npPATH_DELIMITER);
  461.                     else
  462.                     {
  463.                         $test false;
  464.                         $found false;
  465.                         for($i=0;$i count($mp&& $i count($np);$i++)
  466.                         {
  467.                             if (PHPDOCUMENTOR_WINDOWS)
  468.                             {
  469.                                 if (strtolower($mp[$i]!= strtolower($np[$i])) $found $i;
  470.                             else
  471.                             {
  472.                                 if ($mp[$i!= $np[$i]$found $i;
  473.                             }
  474.                         }
  475.                         if ($found !== false)
  476.                         {
  477.                             $mp array_slice($mp,0,$found);
  478.                             $masterPath join($mp,PATH_DELIMITER);
  479.                         }
  480.                     }
  481.                 }
  482.             }
  483.         }
  484.         return $masterPath;
  485.     }
  486.    
  487.     /**
  488.      * Retrieve tutorial subdirectories and their contents from the list of
  489.      * files to parse
  490.      * @param array array of paths (strings)
  491.      * @return array array(filelist - tutorials, tutorials)
  492.      */
  493.     function getTutorials($filelist)
  494.     {
  495.         $list $tutorials array();
  496.         foreach($filelist as $file)
  497.         {
  498.             if (strpos($file,'tutorials/'!== false)
  499.             {
  500.                 $tutedir explode('/',substr($file,strpos($file,'tutorials/')));
  501.                 array_shift($tutedir);
  502.                 if (count($tutedir<= 3)
  503.                 {
  504.                     $res array();
  505.                     // kludge - will need to fix for 2.0
  506.                     $res['category'$GLOBALS['phpDocumentor_DefaultCategoryName'];
  507.                     $res['package'array_shift($tutedir);
  508.                     $res['subpackage''';
  509.                     if (count($tutedir1)
  510.                     $res['subpackage'array_shift($tutedir);
  511.                     $f array_shift($tutedir);
  512.                     $res['tutename'$f;
  513.                     $f explode('.',$f);
  514.                     $res['tutetype'array_pop($f);
  515.                     if ($res['tutetype'== 'ini'continue;
  516.                     $res['path'$file;
  517.                     if (@file_exists($file '.ini'))
  518.                     {
  519.                         $res['ini'phpDocumentor_parse_ini_file($file '.ini'true);
  520.                     else
  521.                     {
  522.                         $res['ini'false;
  523.                     }
  524.                     $tutorials[$res;
  525.                 }
  526.             else $list[$file;
  527.         }
  528.         return array($list,$tutorials);
  529.     }
  530.    
  531.     /**
  532.      * @param string base directory from {@link getBase()}
  533.      * @param array file list from {@link dirList()}
  534.      * @return array array(filelist - README/INSTALL/CHANGELOG,
  535.      *                      README/INSTALL/CHANGELOG)
  536.      */
  537.     function getReadmeInstallChangelog($base,$filelist)
  538.     {
  539.         $list $ric array();
  540.         $names $GLOBALS['_phpDocumentor_RIC_files'];
  541.         foreach($filelist as $file)
  542.         {
  543.             if ((dirname($file== $base&& in_array(strtoupper(basename($file))$names))
  544.             // be sure to change $this->checkIgnore() if any other files are added here!!
  545.                 $ric[$file;
  546.             else
  547.             {
  548.                 $list[$file;
  549.             }
  550.         }
  551.         return array($list,$ric);
  552.     }
  553.  
  554.     /**
  555.      * @param string directory
  556.      * @param string base directory
  557.      * @param array array of ignored items
  558.      * @param boolean the "hidden" flag
  559.      * @param boolean the "ignoresymlinks" flag
  560.      * @uses dirList
  561.      * @uses checkIgnore
  562.      * @uses setup_dirs
  563.      */   
  564.     function getDirTree($dir$base_dir$ignore array()$hidden false$ignoresymlinks false)
  565.     {
  566.         $allfiles $this->dirList($dir,$hidden,$ignoresymlinks);
  567.         $struc array();
  568.         foreach($allfiles as $file)
  569.         {
  570.             if ($this->checkIgnore(basename($file),dirname(realpath($file)),$ignore,$ignoresymlinks)) continue;
  571.             if (PHPDOCUMENTOR_WINDOWS{
  572.                 $path substr(dirname($file),strlen(str_replace('\\','/',realpath($base_dir))));
  573.             else {
  574.                 $path substr(dirname($file),strlen(str_replace('\\','/',realpath($base_dir)))+1);
  575.             }
  576.             if (!$path$path '/';
  577.             $parts pathinfo($file);
  578.             if (!isset($parts['extension']))
  579.             {
  580.                 $parts['extension''';
  581.             }
  582.             $struc[$path][array(
  583.                 'file' => $parts['basename'],
  584.                 'ext' => $parts['extension'],
  585.                 'path' => $file);
  586.         }
  587.         uksort($struc,'strnatcasecmp');
  588.         foreach($struc as $key => $ind)
  589.         {
  590.             usort($ind,'Ioinc_sortfiles');
  591.             $struc[$key$ind;
  592.             $save $key;
  593.             if ($key != '/')
  594.             {
  595.                 $key explode('/',$key);
  596.                 while (count($key))
  597.                 {
  598.                     array_pop($key);
  599.                     if (isset($struc[join('/',$key)]))
  600.                     {
  601.                         $struc[join('/',$key)][substr($save,strlen(join('/',$key)) 1)$ind;
  602.                         unset($struc[$save]);
  603.                     }
  604.                 }
  605.             }
  606.         }
  607.         foreach($struc as $key => $ind)
  608.         {
  609.             if ($key != '/')
  610.             {
  611.                 if (count(explode('/',$key)) == 1)
  612.                 {
  613.                     $struc['/'][$key$struc[$key];
  614.                     unset($struc[$key]);
  615.                 }
  616.             }
  617.         }
  618.         $tempstruc $struc;
  619.         unset($tempstruc['/']);
  620.         $leftover_dirs array_keys($tempstruc);
  621.         $splitdirs array();
  622.         foreach($leftover_dirs as $dir)
  623.         {
  624.             $splitdirs[explode('/',$dir);
  625.         }
  626.         $leftover_dirs array();
  627.  
  628.         foreach($splitdirs as $dir)
  629.         {
  630.             $save join($dir,'/');
  631.             $struc['/'setup_dirs($struc['/']$dir$tempstruc[$save]);
  632.             unset($struc[$save]);
  633.         }
  634.         @uksort($struc['/'],'Ioinc_mystrucsort');
  635.         return $struc;
  636.     }
  637.    
  638.     /**
  639.      * Reads a file and returns it as a string
  640.      * Does basic error checking
  641.      *
  642.      * file extensions are set in {@link phpdoc.inc}
  643.      *
  644.      * @global array PHP File extensions, used to validate that $path is a PHP File
  645.      * @global array PHP File extensions in a CVS repository, used to validate that $path is a PHP File
  646.      * @param    string    $path 
  647.      */
  648.     function readPhpFile($path$quietMode false)
  649.     {
  650.         global $_phpDocumentor_cvsphpfile_exts$_phpDocumentor_phpfile_exts;
  651.         // tiberiusblue addition
  652.         $cvsExt $_phpDocumentor_cvsphpfile_exts
  653.         $ext $_phpDocumentor_phpfile_exts;
  654.         if (file_exists($path))
  655.         {
  656.             if (is_file($path))
  657.             {
  658.                 // check extension
  659.                 $tmp explode(".",$path);
  660.                 // tiberiusblue addition
  661.                 $tmp2 $tmp;
  662.                 if (in_array(array_pop($tmp),$ext))
  663.                 {
  664.                     phpDocumentor_out(" -- Parsing file\n");
  665.                     flush();
  666.                     if (function_exists('file_get_contents')) {
  667.                         return file_get_contents($path);
  668.                     }
  669.                     $fp fopen($path,"r");
  670.                     $ret fread($fp,filesize($path));
  671.                     fclose($fp);
  672.                     return $ret;
  673.                 elseif (in_array(array_pop($tmp2),$cvsExt)) 
  674.                
  675.                     phpDocumentor_out(" CVS file [EXPERIMENTAL]\n")
  676.                     flush();
  677.                     if (function_exists('file_get_contents')) {
  678.                         $ret file_get_contents($path);
  679.                     else {
  680.                         $fp fopen($path,"r")
  681.                         $ret fread($fp,filesize($path))
  682.                         fclose($fp)
  683.                     }
  684.                     $ret strstr($ret,"<?");
  685.                     $ret substr($ret,0,strpos($ret,"@\n"));
  686.                     $ret str_replace("@@","@",$ret)
  687.                     return $ret
  688.                 else
  689.                 {
  690.                     phpDocumentor_out(" -- File not parsed, not a php file\n");
  691.                     flush();
  692.                 }
  693.             else {
  694.                 phpDocumentor_out(" -- Unable to read file, not a file\n");
  695.                 flush();
  696.             }
  697.         else {
  698.             phpDocumentor_out(" -- Unable to read file, file does not exist\n");
  699.             flush();
  700.            }
  701.     }
  702.  
  703.     /**
  704.      * Tell whether to ignore a file or a directory
  705.      * allows * and ? wildcards
  706.      *
  707.      * @author Greg Beaver <cellog@php.net>
  708.      * @param    string  $file    just the file name of the file or directory,
  709.      *                           in the case of directories this is the last dir
  710.      * @param    string  $path    the path to consider (should be checked by
  711.      *                             realpath() before, and may be relative)
  712.      * @param    array   $ignore 
  713.      * @param    bool 
  714.      * @param    bool    Ignore symlinks?
  715.      * @return   bool    true if $path should be ignored, false if it should not
  716.      */
  717.     function checkIgnore($file,$path,$ignore,$ignore_no_ext true,$ignoresymlinks false)
  718.     {
  719.         global $_phpDocumentor_RIC_files;
  720.  
  721.         if ($ignoresymlinks && is_link($path PATH_DELIMITER $file)) return false;
  722.        
  723.         if (!count($ignore)) return false;
  724.  
  725.         if (!isset($this->ignore))
  726.         {
  727.             $this->_setupIgnore($ignore);
  728.         }
  729.         if (!$this->ignore)
  730.         {
  731.             return false;
  732.         }
  733.  
  734.         if ($ignore_no_ext && 
  735.             !in_array(strtoupper($file)$_phpDocumentor_RIC_files))
  736.         {
  737.             if (!is_numeric(strpos($file,'.'))) return true;
  738.         }
  739.         if (is_array($this->ignore))
  740.         {
  741.             foreach($this->ignore as $match)
  742.             {
  743.                 // match is an array if the ignore parameter was a /path/to/pattern
  744.                 if (is_array($match))
  745.                 {
  746.                     // check to see if the path matches with a path delimiter appended
  747.                     preg_match('/^' strtoupper($match[0]).'$/'strtoupper($pathPATH_DELIMITER,$find);
  748.                     if (!count($find))
  749.                     {
  750.                         // check to see if it matches without an appended path delimiter
  751.                         preg_match('/^' strtoupper($match[0]).'$/'strtoupper($path)$find);
  752.                     }
  753.                     if (count($find))
  754.                     {
  755.                         // check to see if the file matches the file portion of the regex string
  756.                         preg_match('/^' strtoupper($match[1]).'$/'strtoupper($file)$find);
  757.                         if (count($find))
  758.                         {
  759.                             return true;
  760.                         }
  761.                     }
  762.                     // check to see if the full path matches the regex
  763.                     preg_match('/^' strtoupper($match[0]).'$/',
  764.                                strtoupper($path DIRECTORY_SEPARATOR $file)$find);
  765.                     if (count($find))
  766.                     {
  767.                         return true;
  768.                     }
  769.                 else
  770.                 {
  771.                     // ignore parameter was just a pattern with no path delimiters
  772.                     // check it against the path
  773.                     preg_match('/^' strtoupper($match).'$/'strtoupper($path)$find);
  774.                     if (count($find))
  775.                     {
  776.                         return true;
  777.                     }
  778.                     // check it against the file only
  779.                     preg_match('/^' strtoupper($match).'$/'strtoupper($file)$find);
  780.                     if (count($find))
  781.                     {
  782.                         return true;
  783.                     }
  784.                 }
  785.             }
  786.         }
  787.         return false;
  788.     }
  789.    
  790.     /**
  791.      * Construct the {@link $ignore} array
  792.      * @author Greg Beaver <cellog@php.net>
  793.      * @param array strings of files/paths/wildcards to ignore
  794.      * @access protected
  795.      */
  796.     function _setupIgnore($ignore)
  797.     {
  798.         $ig array();
  799.         if is_array($ignore))
  800.         {
  801.             $this->ignore = false;
  802.             return;
  803.         }
  804.         for($i=0$i<count($ignore);$i++)
  805.         {
  806.             if (empty($ignore[$i]))
  807.                 continue;
  808.  
  809.             $ignore[$istrtr($ignore[$i]'\\''/');
  810.             $ignore[$istr_replace('//','/',$ignore[$i]);
  811.  
  812.             if (!is_numeric(strpos($ignore[$i],PATH_DELIMITER)))
  813.             {
  814.                 $ig[$this->getRegExpableSearchString($ignore[$i]);
  815.             else
  816.             {
  817.                 if (basename($ignore[$i]PATH_DELIMITER == $ignore[$i])
  818.                 $ig[$this->getRegExpableSearchString($ignore[$i]);
  819.                 else
  820.                 $ig[array($this->getRegExpableSearchString($ignore[$i]),$this->getRegExpableSearchString(basename($ignore[$i])));
  821.             }
  822.         }
  823.         if (count($ig)) $this->ignore = $ig;
  824.     }
  825.    
  826.     /**
  827.      * Converts $s into a string that can be used with preg_match
  828.      * @param string $s string with wildcards ? and *
  829.      * @author Greg Beaver <cellog@php.net>
  830.      * @return string converts * to .*, ? to ., etc.
  831.      */
  832.     function getRegExpableSearchString($s)
  833.     {
  834.         $y '\/';
  835.         if (DIRECTORY_SEPARATOR == '\\')
  836.         {
  837.             $y '\\\\';
  838.         }
  839.         $s str_replace('/'DIRECTORY_SEPARATOR$s);
  840.         $x strtr($sarray('?' => '.','*' => '.*','.' => '\\.','\\' => '\\\\','/' => '\\/',
  841.                                 '[' => '\\[',']' => '\\]','-' => '\\-'));
  842.         if (strpos($sDIRECTORY_SEPARATOR!== false &&
  843.             strrpos($sDIRECTORY_SEPARATOR=== strlen($s1)
  844.         {
  845.             $x "(?:.*$y$x?.*|$x.*)";
  846.         }
  847.         return $x;
  848.     }
  849.    
  850.     /**
  851.      * Removes files from the $dir array that do not match the search string in
  852.      * $match
  853.      * @param array $dir array of filenames (full path)
  854.      * @param string $match search string with wildcards
  855.      * @author Greg Beaver <cellog@php.net>
  856.      * @return string|arraylisting of every file in a directory that matches
  857.      *                       the search string
  858.      */
  859.     function removeNonMatches($dir$match)
  860.     {
  861.         $match $this->getRegExpableSearchString($match);
  862.         $nodir false;
  863.         if (!is_array($dir))
  864.         {
  865.             $dir array($dir);
  866.             $nodir true;
  867.         }
  868.         foreach($dir as $i => $file)
  869.         {
  870.             preg_match('/^'.$match.'$/',basename($file),$find);
  871.             if (!count($find)) unset($dir[$i]);
  872.         }
  873.         if ($nodirreturn $dir[0];
  874.         return $dir;
  875.     }
  876.    
  877.     /**
  878.      * Take a filename with wildcards and return all files that match the
  879.      * wildcards
  880.      * @param string $file a full path from the -f command-line parameter, with
  881.      *  potential * and ? wildcards.
  882.      * @return mixed if $file contains wildcards, returns an array of matching
  883.      *                files, otherwise returns false
  884.      * @author Greg Beaver <cellog@php.net>
  885.      * @uses dirList
  886.      * @uses removeNonMatches
  887.      */
  888.     function getAllFiles($file)
  889.     {
  890.         $path realpath(dirname($file));
  891.         $file basename($file);
  892.         // any wildcards?
  893.         if (is_numeric(strpos($file,'?')) || is_numeric(strpos($file,'*')))
  894.         {
  895.             $files $this->dirList($path);
  896.             $a $this->removeNonMatches($files,$file);
  897.             return $a;
  898.         }
  899.         return false;
  900.     }
  901. }
  902.  
  903. /**#@+
  904.  * Sorting functions for the file list
  905.  * @param string
  906.  * @param string
  907.  */
  908. function Ioinc_sortfiles($a$b)
  909. {
  910.     return strnatcasecmp($a['file'],$b['file']);
  911. }
  912.  
  913. function Ioinc_mystrucsort($a$b)
  914. {
  915.     if (is_numeric($a&& is_string($b)) return 1;
  916.     if (is_numeric($b&& is_string($a)) return -1;
  917.     if (is_numeric($a&& is_numeric($b))
  918.     {
  919.         if ($a $breturn 1;
  920.         if ($a $breturn -1;
  921.         if ($a == $breturn 0;
  922.     }
  923.     return strnatcasecmp($a,$b);
  924. }
  925. /**#@-*/
  926.  
  927. /**
  928.  * Recursively add all the subdirectories of $contents to $dir without erasing anything in
  929.  * $dir
  930.  * @param array 
  931.  * @param array 
  932.  * @return array processed $dir
  933.  */
  934. function set_dir($dir,$contents)
  935. {
  936.     while(list($one,$twoeach($contents))
  937.     {
  938.         if (isset($dir[$one]))
  939.         {
  940.             $dir[$oneset_dir($dir[$one],$contents[$one]);
  941.         else $dir[$one$two;
  942.     }
  943.     return $dir;
  944. }
  945.  
  946. /**
  947.  * Recursively move contents of $struc into associative array
  948.  *
  949.  * The contents of $struc have many indexes like 'dir/subdir/subdir2'.
  950.  * This function converts them to
  951.  * array('dir' => array('subdir' => array('subdir2')))
  952.  * @param array struc is array('dir' => array of files in dir,'dir/subdir' => array of files in dir/subdir,...)
  953.  * @param array array form of 'dir/subdir/subdir2' array('dir','subdir','subdir2')
  954.  * @return array same as struc but with array('dir' => array(file1,file2,'subdir' => array(file1,...)))
  955.  */
  956. function setup_dirs($struc,$dir,$contents)
  957. {
  958.     if (!count($dir))
  959.     {
  960.         foreach($contents as $dir => $files)
  961.         {
  962.             if (is_string($dir))
  963.             {
  964.                 if (strpos($dir,'/'))
  965.                 {
  966.                     $test true;
  967.                     $a $contents[$dir];
  968.                     unset($contents[$dir]);
  969.                     $b explode('/',$dir);
  970.                     $c array_shift($b);
  971.                     if (isset($contents[$c]))
  972.                     {
  973.                         $contents[$cset_dir($contents[$c],setup_dirs(array(),$b,$a));
  974.                     else $contents[$csetup_dirs(array(),$b,$a);
  975.                 }
  976.             }
  977.         }
  978.         return $contents;
  979.     }
  980.     $me array_shift($dir);
  981.     if (!isset($struc[$me])) $struc[$mearray();
  982.     $struc[$mesetup_dirs($struc[$me],$dir,$contents);
  983.     return $struc;
  984. }
  985.  
  986. if (!function_exists('get_include_path')) {
  987. function get_include_path()
  988. {
  989.     return ini_get('include_path');
  990. }
  991. }
  992. ?>
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